Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms