Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Surf6P70279 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms