Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb7P70195 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Psmb7P70195 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb7P70195 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms