Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpnP63163 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpnP63163 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms