Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabrb3P63080 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabrb3P63080 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms