Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps3P62908 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps3P62908 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms