Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps4xP62702 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms