Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lmo4P61969 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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