Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms