Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copz1P61924 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms