Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Arf3P61205 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms