Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sem1P60897 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sem1P60897 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms