Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia3P60469 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms