Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp4P59240 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp4P59240 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp4P59240 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms