Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Strn4P58404 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Strn4P58404 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms