Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samsn1P57725 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samsn1P57725 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms