Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms