Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms