Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aqp4P55088 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms