Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acod1P54987 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acod1P54987 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms