Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad23bP54728 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad23bP54728 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad23bP54728 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms