Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fdft1P53798 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fdft1P53798 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms