Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DbtP53395 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DbtP53395 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DbtP53395 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms