Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr5P51682 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr5P51682 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms