Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1swP51491 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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