Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RorcP51450 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RorcP51450 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RorcP51450 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RorcP51450 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms