Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RoraP51448 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RoraP51448 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RoraP51448 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms