Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms