Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpdP50404 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms