Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Epb42P49222 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms