Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp3P49194 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms