Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LmnaP48678 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LmnaP48678 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LmnaP48678 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LmnaP48678 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms