Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prox1P48437 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms