Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms