Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TgfaP48030 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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