Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gli1P47806 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gli1P47806 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gli1P47806 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gli1P47806 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms