Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax7P47239 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms