Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtgfrP43117 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PtgfrP43117 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtgfrP43117 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtgfrP43117 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtgfrP43117 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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