Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkx2-5P42582 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-5P42582 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms