Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tac1P41539 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tac1P41539 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tac1P41539 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms