Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LtbP41155 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbP41155 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbP41155 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LtbP41155 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LtbP41155 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LtbP41155 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms