Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf3rP40223 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms