Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk2P38575 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk2P38575 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk2P38575 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk2P38575 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk2P38575 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms