Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PpargP37238 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PpargP37238 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PpargP37238 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PpargP37238 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PpargP37238 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PpargP37238 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms