Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprkP35822 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprkP35822 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms