Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms