Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grin1P35438 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin1P35438 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin1P35438 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms