Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TpoP35419 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TpoP35419 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TpoP35419 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TpoP35419 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TpoP35419 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TpoP35419 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms