Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab20P35295 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms