Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mmp12P34960 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp12P34960 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms